dplyr 패키지
dplyr 패키지란?
: dplyr 패키지는 데이터 전처리에서 굉~~~~장히 많이 쓰이는 패키지로, dplyr과 tidyr, reshape2, stringr 이 4가지 패키지만 다룰 수 있어도 데이터 핸들링은 거의 다 할 수 있다고 해도 과언이 아니다.
특히 tidyr, reshape2, stringr은 보다 원초적인 상황(데이터가 지저분하게 섞여 있거나, 텍스트 마이닝을 하는 상황)에서 주로 쓰인다면, dplyr은 공공데이터포털 등과 같은 어느정도 정제된(한 셀에 하나의 원소만 들어가 있는) 원시자료를 사용할 때, dplyr 하나만 있어도 충분하다고 할 정도로 다양한 기능을 제공한다고 할 수 있다.
이제 dplyr 패키지가 얼마나 중요한지는 알겠는데, 데이터 전처리가 대체 무엇이길래 dplyr 패키지가 중요하다는 것일까? 이번엔 데이터 전처리에 대해서 간략하게 알아보자.
데이터 전처리(Data Preprocessing)란?
데이터 전처리는 데이터 가공(Data Manipulation), 데이터 핸들링(Data Handling), 데이터 랭글링(Data Wrangling), 데이터 먼징(Data Munging) 등 다양한 이름으로 불리며, 원시적인 상태의 데이터를 내가 원하는 형태로 바꿔주는 모든 과정을 말한다.
데이터 전처리는 데이터에서 내가 원하는 정보를 찾아내는 데이터 분석의 모든 과정에서 약 80% 가까운 비중을 차지할 정도로 매우 중요한 작업이며, 우리가 아는 회귀분석, 랜덤포레스트, 군집분석 등과 같은 멋들어진 이름을 가진 분석 기법들은 이 데이터 전처리 작업을 거치지 않는다면, 실시할 수 없다.
몇 몇 데이터 분석가는 데이터 전처리를 단순하고, 귀찮고, 아까운 시간이 소모되는 과정이라고도 생각하는데, 데이터 전처리 과정에서 데이터를 세세하게 뜯어보며 내가 원하는 형태로 만들어가다보면, 데이터 자체에 대한 이해와 데이터 자체의 특성을 이용해 보다 효율적이고 논리적인 변수를 만들어낼 수 있고, 사용하고자 하는 분석 기법에 맞게 데이터를 만들어주는 과정에서 분석 기법에 대한 심층적인 이해와 같이 다양한 insight를 얻을 수도 있다.
그만큼 데이터 전처리는 중요하고, 데이터 전처리 과정에서 코딩 실력 역시 많이 늘게 되므로, 꼭 데이터 전처리의 필수 패키지인 dplyr를 공부해보도록 하자.
dplyr 패키지의 특징
- R 데이터 타입의 꽃이라고 할 수 있는 데이터 프레임 처리에 특화된 패키지이다.
- C++ 을 기반으로 만들어졌기 때문에 매우 빠르다.
- 파이프 라인(%>%)이라는 연산자를 사용할 수 있으며, 그로인해 코드의 가독성이 매우 크게 올라간다.
- 파이프 라인의 단축키는 Alt + Shift + m 이다.
- R을 효과적으로 사용하려면 apply함수(다음에 자세히 다루겠다.)의 기능을 아주 쉽게 쓸 수 있다.
- tibble이라는 데이터 프레임을 보다 편리하게 쓸 수 있는 데이터 타입을 제공한다.
자 그럼 이제 본격적으로 dplyr 패키지에 대해 공부해보도록 하자.
※ 예제 데이터
# 예제 데이터
name = c("쯔위", "미나", "다현", "모모", "나연", "정연", "사나", "지효", "채영")
math = c(100, 75, 90, 60, 65, 70, 80, 70, 100)
english = c(80, 80, 65, 45, 70, 80, 70, 65, 75)
Korean = c(65, 70, 70, 80, 90, 60, 60, 85, 80)
exam = data.frame(name, math, english, Korean)
exam
## name math english Korean
## 1 쯔위 100 80 65
## 2 미나 75 80 70
## 3 다현 90 65 70
## 4 모모 60 45 80
## 5 나연 65 70 90
## 6 정연 70 80 60
## 7 사나 80 70 60
## 8 지효 70 65 85
## 9 채영 100 75 80
컬럼 이름 바꾸기
- rename()
: dplyr 패키지의 rename()이란 함수로, 기존의 dataframe에서 컬럼의 이름을 바꾸려면, colnames()란 함수를 이용해서 벡터로 새로운 컬럼명이 포함된 컬럼의 이름 벡터를 넣어줘야했지만, rename()함수는 내가 원하는 컬럼의 이름만 바꿀 수 있다. - 주요 Parameter
rename(data, afterColumnName1 = beforeColumnName1, afterColumnName2 = beforeColumnName2)
바꾼 후 컬럼의 이름 = 바꾸기 전 컬럼 이름으로 넣으면 된다. - 컬럼 이름에서 english는 Eng, Korean은 Kr로 바꿔보자.
1) 일반적인 함수 사용.
library(dplyr)
# 컬럼을 dplyr의 rename()함수로 바꿔주자.
rename(exam, Eng = english, Kr = Korean)
## name math Eng Kr
## 1 쯔위 100 80 65
## 2 미나 75 80 70
## 3 다현 90 65 70
## 4 모모 60 45 80
## 5 나연 65 70 90
## 6 정연 70 80 60
## 7 사나 80 70 60
## 8 지효 70 65 85
## 9 채영 100 75 80
2) 파이프라인 사용.
# 파이프라인을 써서 컬럼의 이름을 바꿔보자.
exam = exam %>% rename(Eng = english, Kr = Korean)
## name math Eng Kr
## 1 쯔위 100 80 65
## 2 미나 75 80 70
## 3 다현 90 65 70
## 4 모모 60 45 80
## 5 나연 65 70 90
## 6 정연 70 80 60
## 7 사나 80 70 60
## 8 지효 70 65 85
## 9 채영 100 75 80
- 자 1)과 2)를 보면, 함수의 재료가 되는 data가 함수 안에 있느냐 밖에 있느냐란 차이가 생겼다.
- 파이프라인은 dplyr 패키지의 특징 중 하나로, 파이프라인을 쓰면, 최소한의 변수만 지정하여, 데이터 핸들링을 할 수 있다. 그로 인해 코드의 가독성이 증가하고, 변수명을 잘못 써서 오류가 발생하는 일도 줄일 수 있다.
- 아직은 잘 와닿지 않을테니, 좀 더 학습을 진행해보자.
새로운 컬럼 만들기
- mutate()
: 기존의 변수를 조합하거나 다른 함수를 적용하여 새로운 컬럼을 만들 수 있다. - mutate 함수의 괄호 안에 생성하고 싶은 변수 식을 넣으면 된다.
- mutate 함수를 이용하여 변수를 n개 만드는 경우 괄호 안에서 변수식을 쉼표로 연결하면 된다.
- R(기초) 데이터프레임에서 다루었던 "df$newColumn <- 벡터"와 유사하지만 보다 사용하기 직관적이다.
- 파이프라인을 사용하여, 총점, 평균, 등급 컬럼을 생성해보자.
(등급은 80점을 초과하는 경우 A등급, 70점을 초과하는 경우 B등급, 나머지는 C등급으로 한다.)
# 총점, 평균, 등급 변수를 생성해보자.
library(dplyr)
exam = exam %>% mutate(total = math + Eng + Kr,
mean = total/3,
grade = ifelse(mean > 80, "A", ifelse(mean > 70, "B", "C")))
- 생성된 결과를 원 데이터 변수의 이름에 담거나 다른 변수의 이름에 담아야만 생성된 결과가 반영된다.
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
## 2 미나 75 80 70 225 75.00000 B
## 3 다현 90 65 70 225 75.00000 B
## 4 모모 60 45 80 185 61.66667 C
## 5 나연 65 70 90 225 75.00000 B
## 6 정연 70 80 60 210 70.00000 C
## 7 사나 80 70 60 210 70.00000 C
## 8 지효 70 65 85 220 73.33333 B
## 9 채영 100 75 80 255 85.00000 A
- ifelse는 조건문으로, 컬럼을 새로운 컬럼으로 만들어낼 때, 조건을 부여한다.
- ifelse 함수 사용법
- ifelse(변수이름 논리연산자, TRUE인 경우 값, FALSE인 경우 값)
- FALSE인 경우 값에 또 ifelse를 추가할 수 있다.
- ex1) ifelse(math > 80, "A", "B")
math가 80 초과일 때 A, 그렇지 않을 때 B로 한다. - ex2) ifelse(math > 80, ifelse(math > 70, "B", "C")
math가 80 초과일 때 A, 그렇지 않은 경우 70 초과일 때 B, 나머지는 C로 한다.
- ifelse의 값에서 일부 값은 원래 값으로 할 수도 있다.
- 점수가 75점 미만인 사람은 "바뀐값"으로, 나머지는 본인의 점수인 NewCol을 만들어보자.
exam %>% mutate(NewCol = ifelse(mean >= 75, mean, "바뀐값"))
## name math Eng Kr total mean grade NewCol
## 1 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A 81.66667
## 2 미나 75 80 70 225 75.00000 B 75
## 3 다현 90 65 70 225 75.00000 B 75
## 4 모모 60 45 80 185 61.66667 C 바뀐값
## 5 나연 65 70 90 225 75.00000 B 75
## 6 정연 70 80 60 210 70.00000 C 바뀐값
## 7 사나 80 70 60 210 70.00000 C 바뀐값
## 8 지효 70 65 85 220 73.33333 B 바뀐값
## 9 채영 100 75 80 255 85.00000 A 85
- 위에 사용한 함수를 보면, 본래의 컬럼 이름인 mean을 그대로 넣은 영역인 본래의 값이 나왔다.
필요한 행(Row)만 추출하기
- filter()
: 조건을 걸어 사용자가 원하는 행만 출력할 수 있다. - 연산자와 데이터 타입에서 공부한 논리연산자를 활용해보자.
# exam에서 grade가 A인 학생들만 추출해보자.
exam %>% filter(grade == "A")
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
## 2 채영 100 75 80 255 85.00000 A
# exam에서 math가 70점보다 높은 학생들을 출력해보자.
exam %>% filter(math >= 70)
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
## 2 미나 75 80 70 225 75.00000 B
## 3 다현 90 65 70 225 75.00000 B
## 4 정연 70 80 60 210 70.00000 C
## 5 사나 80 70 60 210 70.00000 C
## 6 지효 70 65 85 220 73.33333 B
## 7 채영 100 75 80 255 85.00000 A
# exam에서 math가 70점 이상이면서 Eng가 80점 이상인 학생들을 출력해보자.
exam %>% filter(math >= 70 & Eng >= 80)
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
## 2 미나 75 80 70 225 75.00000 B
## 3 정연 70 80 60 210 70.00000 C
# exam에서 math가 90점 이상이거나 Eng가 80점 이상인 학생들을 출력해보자.
exam %>% filter(math >= 90 | Eng >= 80)
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
## 2 미나 75 80 70 225 75.00000 B
## 3 다현 90 65 70 225 75.00000 B
## 4 정연 70 80 60 210 70.00000 C
## 5 채영 100 75 80 255 85.00000 A
# exam에서 grade가 B가 아닌 학생들만 출력해보자.
exam %>% filter(grade != "B")
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
## 2 모모 60 45 80 185 61.66667 C
## 3 정연 70 80 60 210 70.00000 C
## 4 사나 80 70 60 210 70.00000 C
## 5 채영 100 75 80 255 85.00000 A
# exam에서 math가 70점 이상이면서 Eng가 70점 이상이고 Kr가 70점 이상인 학생들만 출력해보자.
exam %>% filter(math >= 70 & Eng >= 70 & Kr >= 70)
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 미나 75 80 70 225 75 B
## 2 채영 100 75 80 255 85 A
필요한 컬럼(Column)만 추출하기
- select()
: 원하는 열만 추출할 수 있다. - "R(기초) 데이터프레임"에서 학습한 Indexing 방법과 동일한 기능과 비슷한 사용방법을 가지고 있으며, 사용하지 않아도 큰 불편은 없으나, 파이프라인을 사용하여 dplyr의 다른 함수들과 조합한다면, 상당히 편리한 함수라고 할 수 있다.
# exam에서 math, Eng 컬럼만 가지고 온다.
exam %>% select(math, Eng)
## math Eng
## 1 100 80
## 2 75 80
## 3 90 65
## 4 60 45
## 5 65 70
## 6 70 80
## 7 80 70
## 8 70 65
## 9 100 75
# exam에서 -math 컬럼을 제외하고 가지고 온다.
exam %>% select(-math)
## name Eng Kr total mean grade
## 1 쯔위 80 65 245 81.66667 A
## 2 미나 80 70 225 75.00000 B
## 3 다현 65 70 225 75.00000 B
## 4 모모 45 80 185 61.66667 C
## 5 나연 70 90 225 75.00000 B
## 6 정연 80 60 210 70.00000 C
## 7 사나 70 60 210 70.00000 C
## 8 지효 65 85 220 73.33333 B
## 9 채영 75 80 255 85.00000 A
# exam에서 math부터 Kr까지 가지고 온다.
exam %>% select(math : Kr)
## math Eng Kr
## 1 100 80 65
## 2 75 80 70
## 3 90 65 70
## 4 60 45 80
## 5 65 70 90
## 6 70 80 60
## 7 80 70 60
## 8 70 65 85
## 9 100 75 80
순서대로 정렬하기.
- arrange()
: 특정 컬럼을 원하는 순서로 정렬할 수 있다.
arrage(컬럼이름) - 오름차순은 Default 값으로 돼 있다.
- 내림차순을 원하는 경우 arrage(desc(컬럼이름))을 하면 된다.
- 여러 변수를 기준으로 정렬을 하고 싶은 경우 arrage()함수 안에 컬럼의 이름을 여러 개 넣으면 된다.
# exam에서 math를 오름차순 정렬해보자.
exam %>% arrange(math)
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 모모 60 45 80 185 61.66667 C
## 2 나연 65 70 90 225 75.00000 B
## 3 정연 70 80 60 210 70.00000 C
## 4 지효 70 65 85 220 73.33333 B
## 5 미나 75 80 70 225 75.00000 B
## 6 사나 80 70 60 210 70.00000 C
## 7 다현 90 65 70 225 75.00000 B
## 8 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
## 9 채영 100 75 80 255 85.00000 A
# exam에서 Eng를 내림차순 정렬해보자.
exam %>% arrange(desc(math))
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
## 2 채영 100 75 80 255 85.00000 A
## 3 다현 90 65 70 225 75.00000 B
## 4 사나 80 70 60 210 70.00000 C
## 5 미나 75 80 70 225 75.00000 B
## 6 정연 70 80 60 210 70.00000 C
## 7 지효 70 65 85 220 73.33333 B
## 8 나연 65 70 90 225 75.00000 B
## 9 모모 60 45 80 185 61.66667 C
# exam에서 math, Eng 순으로 오름차순 정렬해보자.
exam %>% arrange(math, Eng)
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 모모 60 45 80 185 61.66667 C
## 2 나연 65 70 90 225 75.00000 B
## 3 지효 70 65 85 220 73.33333 B
## 4 정연 70 80 60 210 70.00000 C
## 5 미나 75 80 70 225 75.00000 B
## 6 사나 80 70 60 210 70.00000 C
## 7 다현 90 65 70 225 75.00000 B
## 8 채영 100 75 80 255 85.00000 A
## 9 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
# exam에서 math는 오름차순, Eng는 내림차순 순서로 정렬해보자.
exam %>% arrange(math, desc(Eng))
## name math Eng Kr total mean grade
## 1 모모 60 45 80 185 61.66667 C
## 2 나연 65 70 90 225 75.00000 B
## 3 정연 70 80 60 210 70.00000 C
## 4 지효 70 65 85 220 73.33333 B
## 5 미나 75 80 70 225 75.00000 B
## 6 사나 80 70 60 210 70.00000 C
## 7 다현 90 65 70 225 75.00000 B
## 8 쯔위 100 80 65 245 81.66667 A
## 9 채영 100 75 80 255 85.00000 A
컬럼별 요약하기와 집단별로 요약하기
- group_by()
: 한 컬럼 안에 있는 집단별로 그룹을 묶는다. - group_by() 안에 컬럼의 이름이 n개가 들어가면, 그룹을 여러 컬럼에 대해서 나눌 수 있다.
- summarise()
: 총합, 평균과 같은 요약 통계량을 추출한다. - summarise() 함수는 데이터 안에 결측값이 하나라도 있는 경우 결과를 결측값으로 출력한다.
na.rm = TRUE를 내가 구하려는 요약통계량 함수 안에 넣는 경우, 결측값을 제외하고 결과를 출력한다. - 집단별 요약은 위 2개 함수를 동시에 사용하여 실행한다.
- 위에서 mutate로 만든 평균이나 총합은 특정 변수들을 어떠한 계산식을 통해 만들어낸 새로운 변수라면
- summurise()는 한 변수에 대한 요약 통계량이라고 할 수 있다.
# exam에서 math의 평균을 구해보자.
exam %>% summarise(mean_math = mean(math))
## mean_math
## 1 78.88889
# exam에서 grade별 Eng의 총점과 평균 점수, 빈도를 구해보자.
exam %>% group_by(grade) %>% summarise(mean_Eng = mean(Eng),
total_Eng = sum(Eng),
n())
## `summarise()` ungrouping output (override with `.groups` argument)
## # A tibble: 3 x 4
## grade mean_Eng total_Eng `n()`
## <chr> <dbl> <dbl> <int>
## 1 A 77.5 155 2
## 2 B 70 280 4
## 3 C 65 195 3
- 위 결과가 dplyr에서 사용되는 데이터프레임과 비슷한 데이터 타입인 tibble이다.
- tibble은 차원, 변수별 변수 타입을 보여주는 형태라고 할 수 있다.
※ summarise() 함수에서 자주 사용하는 요약통계량 함수.
함수 | 의미 | 함수 | 의미 |
mean() | 평균 | min() | 최솟값 |
sd() | 표준편차 | max() | 최댓값 |
sum() | 합계 | n() | 빈도 |
median() | 중앙값 |
※ dplyr의 내장 데이터인 starwars를 이용해서 원하는 결과를 만들어보자.
library(dplyr)
# dplyr 패키지의 starwars 데이터의 변수 목록을 가지고 와보자
colnames(starwars)
## [1] "name" "height" "mass" "hair_color" "skin_color"
## [6] "eye_color" "birth_year" "sex" "gender" "homeworld"
## [11] "species" "films" "vehicles" "starships"
- starwars 데이터의 변수 목록을 보고 무엇을 사용할 것인지 판단해보자.
변수내 원소의 종류가 비교적 적을 것으로 판단되는 gender와 species에 대해 분석을 진행해보자.
# starwars 데이터에서 gender, species에 대한 빈도표를 뽑아보자.
table(starwars$gender)
## feminine masculine
## 17 66
- table() 함수는 벡터에 대한 빈도 분석을 하는데 사용하는 함수이다.
(이외에도 여러 기능이 있으나, 이는 이후에 다루도록 하자.)
table(starwars$species)
##
## Aleena Besalisk Cerean Chagrian Clawdite
## 1 1 1 1 1
## Droid Dug Ewok Geonosian Gungan
## 6 1 1 1 3
## Human Hutt Iktotchi Kaleesh Kaminoan
## 35 1 1 1 2
## Kel Dor Mirialan Mon Calamari Muun Nautolan
## 1 2 1 1 1
## Neimodian Pau'an Quermian Rodian Skakoan
## 1 1 1 1 1
## Sullustan Tholothian Togruta Toong Toydarian
## 1 1 1 1 1
## Trandoshan Twi'lek Vulptereen Wookiee Xexto
## 1 2 1 2 1
## Yoda's species Zabrak
## 1 2
- 변수 species는 Human이 35명으로 가장 많고, 나머지는 최소값 1, 최대값 6으로 그 수가 그리 많지 않다. 그러므로 Human, NonHuman 이 2가지 집합으로 이루어진 새로운 변수를 만들어보자.
# starwars 데이터에서 species 컬럼을 Human과 NonHuman 2가지로 나눈 isHuman 컬럼을 만들어보자.
starwars = starwars %>% mutate(isHuman = ifelse(species == "Human", "Human", "NonHuman"))
# starwars 데이터에서 gender, isHuman으로 group_by하여, height에 대한 총합, 평균, 표준편차, 최대값, 최소값, 빈도를 구해보자.
starwars %>% group_by(gender, isHuman) %>% summarise(height_sum = sum(height),
height_mean = mean(height),
height_sd = sd(height),
height_min = min(height),
height_max = max(height),
n())
- 연속형 변수 중에 결측값이 가장 적을 것으로 예측되는 height에 대해 요약 통계량을 생성해보자.
## `summarise()` regrouping output by 'gender' (override with `.groups` argument)
## # A tibble: 5 x 8
## # Groups: gender [3]
## gender isHuman height_sum height_mean height_sd height_min height_max `n()`
## <chr> <chr> <int> <dbl> <dbl> <int> <int> <int>
## 1 feminine Human NA NA NA NA NA 9
## 2 feminine NonHum~ 1353 169. 33.1 96 213 8
## 3 masculine Human NA NA NA NA NA 26
## 4 masculine NonHum~ NA NA NA NA NA 40
## 5 <NA> <NA> NA NA NA NA NA 4
- 분석 결과 대부분이 <NA>로 표시된 것을 알 수 있다.
- <NA>는 값이 없음을 의미한다.
- 데이터 분석을 하기 위해선 이러한 내가 원하지 않는 결과가 나온 경우 그 원인을 파악해보아야한다.
- 위에서 말했듯이 summarise() 함수는 분석하려는 대상인 데이터 안에 결측값(<NA>)이 단 하나라도 있는 경우, 요약통계량을 <NA>로 출력한다. 이 경우 na.rm = TRUE를 각 요약 통계량 안에 삽입하여, 다시 결과를 출력해보자.
# starwars 데이터에서 species 컬럼을 Human과 NonHuman 2가지로 나눈 isHuman 컬럼을 만들어보자.
starwars = starwars %>% mutate(isHuman = ifelse(species == "Human", "Human", "NonHuman"))
# starwars 데이터에서 gender, isHuman으로 group_by하여, height에 대한 총합, 평균, 표준편차, 빈도를 구해보자.
starwars %>% group_by(gender, isHuman) %>% summarise(height_sum = sum(height, na.rm = TRUE),
height_mean = mean(height, na.rm = TRUE),
height_sd = sd(height, na.rm = TRUE),
height_min = min(height, na.rm = TRUE),
height_max = max(height, na.rm = TRUE),
n())
## `summarise()` regrouping output by 'gender' (override with `.groups` argument)
## # A tibble: 5 x 8
## # Groups: gender [3]
## gender isHuman height_sum height_mean height_sd height_min height_max `n()`
## <chr> <chr> <int> <dbl> <dbl> <int> <int> <int>
## 1 feminine Human 1282 160. 6.98 150 167 9
## 2 feminine NonHum~ 1353 169. 33.1 96 213 8
## 3 masculine Human 4194 182. 8.19 170 202 26
## 4 masculine NonHum~ 6750 173. 46.9 66 264 40
## 5 <NA> <NA> 544 181. 2.89 178 183 4
- 도출된 결과를 보면 정상적으로 나온 것을 알 수 있다.
- gender, isHuman에서 <NA>라고 출력된 결과가 있는 것을 볼 수 있다.
- 해당 결과가 나온 원인을 알기 위해 gender와 isHuman에 대한 결측값 여부에 대한 빈도분석을 실시해보자.
- is.na(백터)
: 벡터 안에 결측값이 있는 경우, 해당 결측값을 TRUE로 결측값이 아닌 값을 FALSE로 나타낸다. - table(is.na(벡터))
:위 함수를 이용하면, 해당 벡터 안에 몇 개의 결측값이 존재하는지 쉽게 알 수 있다.
# is.na()함수를 이용해서 결측값의 갯수를 파악해보았다.
table(is.na(starwars$gender))
## FALSE TRUE
## 83 4
table(is.na(starwars$isHuman))
## FALSE TRUE
## 83 4
- 두 함수 모두 결측값이 각각 4개 존재하는 것으로 나타났다.
- 스칼라에서 공부한 Boolean의 성격을 이용해보면, 두 변수의 결측값이 동일한 객체(행)에 대한 것인지를 볼 수 있다.
# 두 변수의 결측값이 중복되는 것인지 확인해보자.
gender = is.na(starwars$gender)
isHuman = is.na(starwars$isHuman)
table(gender + isHuman)
## 0 2
## 83 4
- gender와 isHuman이라는 2개의 벡터를 is.na()를 이용해서 TRUE와 FALSE 2개의 인자로 구성된 벡터를 만들었다.
- 두 벡터를 합치는 경우, 객체(행)에 대한 위치는 두 벡터 모두 동일하므로, 2개 벡터가 같은 객체에 대해 결측값으로 구성된 경우 2가 나올 것이며(TRUE + TRUE = 2), 2개 벡터가 서로 다른 객체에 대해 결측값이 있는 경우 1이 나올 것이다.(TRUE + FALSE = 1)
- 결과가 0과 2로 이루어져있으며, 2의 숫자가 4개인 것을 보면, gender와 isHuman의 결측값을 가진 객체가 일치하는 것을 알 수 있다.
※ summarise 함수에서 na.rm = TRUE의 주의 사항
- gender와 isHuman의 결측값이 동일한 객체(행)에 대해 존재한다는 것을 알았으므로, 이번엔 결측값이 있는 행들을 분석 대상에서 제외하고 보도록 하자.
- 일반적으로 결측값 제거는 함부로 해서는 안되지만, 이는 사회과학에서 그 결측값의 발생이 어떠한 의도에 의해 발생했을 위험이 있기 때문이다.
- 해당 데이터는 할리우드 영화인 Starwars에서 캐릭터들의 이름과 키, 몸무게, 머리카락색과 같은 개인정보가 담긴 데이터이다. 결측값이 발생한 대상에 대해 구체적으로 보도록 하자.
starwars[, c("name", "height", "gender", "isHuman", "species")] %>% filter(is.na(gender))
## # A tibble: 4 x 5
## name height gender isHuman species
## <chr> <int> <chr> <chr> <chr>
## 1 Ric Olie 183 <NA> <NA> <NA>
## 2 Quarsh Panaka 183 <NA> <NA> <NA>
## 3 Sly Moore 178 <NA> <NA> <NA>
## 4 Captain Phasma NA <NA> <NA> <NA>
- 보면 위 캐릭터들은 성별과 종(species)이 결측값(측정할 수 없는) 캐릭터임을 알 수 있다.
- 이번 분석은 성별이 있으며 종이 인간/비인간인 객체를 대상으로 하고 있으므로, 이런 경우엔 위 대상들을 분석 대상에서 아예 제거하고 실시해도 된다.
- 이번엔 결측값이 있는 행을 제거하고 진행해보자
1) 결측값이 행에서 아예 제거된 상태의 결과.
# 분석 대상에서 결측값이 제거된 상태에서 분석 결과
chooseColumns = starwars[,c("gender", "isHuman", "height")]
removeNA = na.omit(chooseColumns)
removeNA %>% group_by(gender, isHuman) %>% summarise(height_sum = sum(height),
height_mean = mean(height),
height_sd = sd(height),
height_min = min(height),
height_max = max(height),
n())
- na.omit()은 결측값이 하나라도 있는 행을 제거하는 함수로, 데이터 전처리에서 필수인 결측값 제거에서 꼭 알고 있어야하는 함수이다.
(추후 결측값에 대해 아주 상세히 다룰 예정이다.)
## `summarise()` regrouping output by 'gender' (override with `.groups` argument)
## # A tibble: 4 x 8
## # Groups: gender [2]
## gender isHuman height_sum height_mean height_sd height_min height_max `n()`
## <chr> <chr> <int> <dbl> <dbl> <int> <int> <int>
## 1 feminine Human 1282 160. 6.98 150 167 8
## 2 feminine NonHum~ 1353 169. 33.1 96 213 8
## 3 masculine Human 4194 182. 8.19 170 202 23
## 4 masculine NonHum~ 6750 173. 46.9 66 264 39
2) na.rm = TRUE를 적용한 결과.
# na.rm = TRUE의 결과.
starwars %>% group_by(gender, isHuman) %>% summarise(height_sum = sum(height, na.rm = TRUE),
height_mean = mean(height, na.rm = TRUE),
height_sd = sd(height, na.rm = TRUE),
height_min = min(height, na.rm = TRUE),
height_max = max(height, na.rm = TRUE),
n())
## `summarise()` regrouping output by 'gender' (override with `.groups` argument)
## # A tibble: 5 x 8
## # Groups: gender [3]
## gender isHuman height_sum height_mean height_sd height_min height_max `n()`
## <chr> <chr> <int> <dbl> <dbl> <int> <int> <int>
## 1 feminine Human 1282 160. 6.98 150 167 9
## 2 feminine NonHum~ 1353 169. 33.1 96 213 8
## 3 masculine Human 4194 182. 8.19 170 202 26
## 4 masculine NonHum~ 6750 173. 46.9 66 264 40
## 5 <NA> <NA> 544 181. 2.89 178 183 4
- 위, 아래 표를 비교해보면 총합, 평균, 표준편차, 최소값, 최댓값은 동일하나, n()이 서로 다르고 , 5번째 행이 위엔 없으나 아래에 있는 것을 볼 수 있다.
- 이는 위의 na.omit()을 이용해서 결측값이 있는 행을 모두 제거한 결과는 행에 서 결측값이 있는 것을 모두 제거하였기 때문에, gender, isHuman, height 이 3가지 변수 중에 <NA>를 하나라도 가진 객체를 분석 대상에서 아예 제거해버렸기 때문에 키에 대한 n()을 제외한 모든 요약 통계량은 같게 나오지만, n()은 na.rm이라는 인자가 아예 존재하지 않기 때문에 다른 결과가 나온 것이다.
- 즉, 간단하게 말하자면 n()는 결측값이 있던 없던 대상의 수를 세버려기 때문에 height에 결측값이 있다할지라도 수를 세어버리고, na.omit()으로 결측값이 있는 행을 모두 제거한 결과는 성별, 종족이 측정된 값이며, 키를 측정한 대상에 한정한 결과를 가져오는 것이다.
- na.rm은 단순하게 해당 벡터에 대해서만 결측값을 제거하므로, na.rm을 적용할 수 없는 n()은 조금 조심해서 사용하도록 하자.
- 위 문제를 명확하게 해결하기 위해선 분석 대상에 대한 명확한 정의가 필요하다.
데이터 합치기
- left_join()
: 두 데이터 프레임을 동일한 열을 기준으로 열로 합치는 경우 left_join()을 사용한다. - left_join(기준이 되는 합쳐지는 쪽, 합칠 데이터)
- 기준이 될 ID와 같은 동일한 컬럼이 필요하다.
- left_join()을 응용하여 특정 변수를 기준으로 새로운 변수를 추가할 수 있다.
- 데이터는 한 번에 2개만 합치는 것이 가능하다.
- cbind()는 열의 길이만 같다면 통으로 합치지만, left_join()은 기준 변수를 제외한 변수들이 기준 변수의 위치에 맞춰서 합춰진다.
- 즉, left_join()에서 기준으로 사용할 열에 일치하는 값만 존재한다면(전부 존재 하지 않아도 된다.) 두 데이터 프레임의 길이가 서로 다르더라도 붙일 수 있다.
- 기준이 되는 합쳐지는 쪽과 합칠 데이터에 대하여, 기준 컬럼의 인자가 동일한 집합이 아닌 경우에도 합쳐지며,기준이 되는 합쳐지는 쪽의 기준 컬럼에 없는 인자들은 모두 NA로 합쳐진다.
- bind_rows()
: 두 데이터 프레임의 열 이름이 동일한 경우 행을 위주로 합치는 경우, bind_rows()를 사용한다.- 세로로 합치는 경우, 합치는 두 데이터의 변수명이 일치해야한다.
- 동일하지 않다면 rename()을 하거나, 일치하지 않는 변수를 제거해주자.
- 합칠 두 데이터 프레임의 컬럼별 변수 타입이 동일해야한다.
- 특히 character와 factor는 단순하게 눈으로 비교해서는 같게 보이므로, 꼭 주의하도록 하자.
# 한 열이 동일한 2개의 데이터 프레임을 한 열을 기준으로 합쳐보자.
mid_examResult = data.frame(name = c("민철", "재성", "현승", "기훈", "윤기"), midterm = c(60, 80, 90, 70, 85))
final_examResult = data.frame(name = c("민철", "재성", "현승", "기훈", "윤기"), finalterm = c(80, 75, 88, 65, 90))
left_join(mid_examResult, final_examResult)
## Joining, by = "name"
## name midterm finalterm
## 1 민철 60 80
## 2 재성 80 75
## 3 현승 90 88
## 4 기훈 70 65
## 5 윤기 85 90
# 열의 이름이 동일한 2개의 데이터 프레임을 행끼리 세로로 합쳐보자.
class1 = data.frame(class = 1, name = c("민철", "재성", "현승", "기훈", "윤기"), mean = c(75, 80, 65, 90, 80))
class2 = data.frame(class = 2, name = c("태경", "시라", "재빈", "미선", "선화"), mean = c(70, 85, 80, 75, 90))
bind_rows(class1, class2)
## class name mean
## 1 1 민철 75
## 2 1 재성 80
## 3 1 현승 65
## 4 1 기훈 90
## 5 1 윤기 80
## 6 2 태경 70
## 7 2 시라 85
## 8 2 재빈 80
## 9 2 미선 75
## 10 2 선화 90
지금까지 dplyr에 대해서 간략한 학습을 해보았다.
이번 포스트에서 공부한 rename, mutate, filter, select, arrange, group_by, summarise, left_join, bind_rows는 개인적으로 dplyr 패키지에서 이것만 알아도 충분하다 싶어서 뽑은 함수들이며, 추후 dplyr에 대해 더 학습을 하다가, 괜찮은 함수가 있다면, 그 함수들도 추가해보도록 하겠다.
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